Федеральные округа выступают федеральными образованиями, которые учреждаются и формируются федеральной властью. Но как структура они были созданы не федеральной исполнительной или судебной властью, а Президентом Российской Федерации. Говоря о регулировании деятельности системы федеральных округов, следует определить, что основную деятельность полномочных представителей Президента РФ в федеральных округах регулирует Указ Президента РФ от 13 мая 2000 года № 849 О полномочном представителе Президента Российской Федерации в федеральном округе . Согласно данному Указу, необходимость образования института полномочных представителей Президента РФ в федеральных округах была вызвана в целях обеспечения реализации Президентом Российской Федерации своих конституционных полномочий, повышения эффективности деятельности федеральных органов государственной власти и совершенствования системы контроля над исполнением их решений . Образование системы федеральных округов, по большей части, оказалось результатом понимания и осмысления на государственном уровне определенных вопросов управления, неудовлетворенности положением законности в регионах России и незначительными показателями эффективности работы территориальных подразделений федеральных органов исполнительной власти.
